二氧化碳培養(yǎng)箱能夠對溫度、二氧化碳濃度和濕度提供穩(wěn)定的控制，以便于其研究工作的進展；二是要求二氧化碳培養(yǎng)箱能夠對培養(yǎng)箱內的微生物污染進行有效的防范，并能夠定期消除污染，以保護研究成果，防止樣品損失。
二氧化碳培養(yǎng)箱應由專人負責使用，操作盤上的任何開關和調節(jié)旋扭一旦固定后，不要隨意扭動，以免影響箱內溫度，二氧化碳濃度，濕度的波動，同時降低機器的靈敏度。箱子的放置要水平，避免陽光直射和灰塵等，要保證儀器周圍的氣流循環(huán)，后部及側面應留出5cm的空隙。加裝穩(wěn)壓電源保證電源電壓波動不超過220V±10%。所加入的水必須是蒸餾水或無離子水，防止礦物質儲積在水箱內產生腐蝕作用，經常檢查箱內水是否足夠，水位應加至“水位指示燈”滅燈時為止。使用前箱內應用消毒酒精或碘溶液擦洗，防止其他微生物污染，導致實驗失敗。在房間安裝空調，使環(huán)境溫度保持在25~C左右。所使用的二氧化碳必須是純凈的，否則降低二氧化碳傳感器的靈敏度和污染二氧化碳過濾裝置。
二氧化碳培養(yǎng)箱箱內氣壓由二氧化碳氣體傳感器控制。二氧化碳傳感器正常反饋要求進氣壓為MedicalEquipmentVo1.22，No.40.06MPa。當箱內氣壓降低時，二氧化碳傳感器在低壓刺激下有節(jié)奏地開閉，向箱內慢慢充氣，當進氣壓達0.1MPa時，自動停止調節(jié)。如充氣方法不當，使進氣壓力增大，當超過0.1MPa甚至0.2MPa壓力，會損傷二氧化碳傳感器。開始這種損傷效應不明顯，不易察覺，反復錯誤操作，二氧化碳傳感器損傷累積終致命損壞，使氣壓調節(jié)失靈。因此，二氧化碳傳感器壽命與二氧化碳進氣壓大小有關，只要做好進氣壓調節(jié)，就能保護二氧化碳傳感器性能。二氧化碳傳感器價格昂貴，更換不易，所以一定要做好進氣壓調節(jié)，延長二氧化碳傳感器使用壽命。
箱內濕度對于培養(yǎng)工作來說是一項非常重要然而又經常被忽略的因素。因為飽和濕度環(huán)境可以避免培養(yǎng)液中二氧化碳逃逸，培養(yǎng)液中pH值穩(wěn)定，有利于細胞生長，足夠的濕度水平并且要有足夠快的濕度恢復速度(如在開關門后)才能保證不會由于過度干燥而導致培養(yǎng)失敗。所以二氧化碳培養(yǎng)箱使用過程中，在箱內托盤中放一定量的滅菌水(3/2至全盤)，使箱內成為飽和濕度環(huán)境。如使用者忘記補加水，使培養(yǎng)細胞處于低濕度甚至干熱環(huán)境中，培養(yǎng)液二氧化碳氣體易揮發(fā)，液體pH值升高，影響細胞生長，在工作中要力求避免此問題發(fā)生。樣本多時，箱內分區(qū)存放，培養(yǎng)物用筐或瓷盤存放，這樣存取快速，縮短開門時間，減少箱內氣體和濕度變化，節(jié)省氣體，穩(wěn)定了細胞生長環(huán)境。
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